序　地球の歴史と生命の進化
　　−−地球の先住民は微生物である　　　今中 忠行

第１編　微生物学の基礎
第１章　純粋培養微生物
　第１節　微生物の進化と分類　　　平石　明
　第２節　細菌（Bacteria）　　　　宮道 慎二
　第３節　始原菌（Archaea）　　　 藤原 伸介
　第４節　真核微生物 
　　１．菌類の分類体系と系統進化　　　　杉山 純多
　　２．下等菌類：主要な菌群と分類　　　杉山 純多／岡田　元
　　３．酵　母　　　　　　　　　　　　　金子 嘉信／上田−西村 久美子
　　４．高等菌類：分類と主要な菌群　　　岡田　元／杉山 純多
　　５．藻　類　　　　　　　　　　　　　山田　隆
　第５節　ウイルス　　　　　　　　　　　山田　隆
第２章　極限環境微生物
　第１節　極限環境微生物の世界　　　　　加藤 千明
　第２節　好アルカリ性微生物　　　　　　伊藤 政博
　第３節　好酸性微生物　　　　　　　　　伊藤 佑子／伊藤 俊洋
　第４節　好熱性微生物　　　　　　　　　藤原 伸介
　第５節　好冷・低温微生物　　　　　　　湯本　勲
　第６節　好塩性微生物　　　　　　　　　中村　聡
　第７節　好圧性微生物　　　　　　　　　仲宗根 薫／能木 裕一
　第８節　絶対嫌気性微生物　　　　　　　伊藤　隆
　第９節　疎水性溶媒耐性微生物
　　　　　−−溶媒耐性機構と溶媒重層発酵　　　青野 力三／道久 則之
　第10節　地殻内微生物，そして地球外微生物探査へ　　　高井　研
第３章　複合微生物系
　第１節　細胞間相互作用の重要性
　　１．複合微生物開発の意義　　　　　　倉根 隆一郎
　　２．バイオフィルム：微生物たちの街　　　森川 正章／R.Kolter
　第２節　分子遺伝学・組織化学的解析技術　　　丸山 明彦／砂村 倫成
　第３節　分離・培養化技術　　　土田 隆康
　第４節　機能解析・システム化技術　　　鈴木 賢一
　第５節　微生物−−微生物複合系利用技術
　　１．機能性物質生産　　　横幕 豊一
　　２．合成高分子分解　　　河合 富佐子
　第６節　シロアリの共生微生物とその利用
　　　　　−−バイオマスリサイクルを支えるシロアリ−微生物複合系
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　新里 尚也／渡辺 吉雄
　第７節　植物−−微生物複合生物系　　　山岡 正和
　第８節　微生物−ヒト複合系利用技術
　　　　　−−プロバイオティクスとプレバイオティクス　　　田中 隆一郎
　第９節　ヒト複合微生物利用技術
　　　　　−−ヒトと腸内細菌叢の共生　　　清水 精一

第４章　VBNC（viable but nonculturable）と遺伝子資源の利用
　第１節　VBNC概念の背景　　　加藤　憲二
　第２節　微生物ゲノムのFunctional Genomics　　　佐川 裕章／加藤 郁之進
　第３節　新規微生物・遺伝子資源の探索　　　藤原 伸介

第５章　微生物の代謝
　第１節　微生物代謝の概要　　　加藤 暢夫
　第２節　糖質の代謝　　　　　　山本 憲二
　第３節　石油成分の分解　　　　渡辺 一哉／濱村 奈津子
　第４節　C1化合物の代謝　　　　加藤 暢夫／由里本 博也
　第５節　光合成　　　　　　　　松岡 正佳／小川 隆平
　第６節　嫌気的代謝　　　　　　五十嵐 泰夫／石井 正治
　第７節　メタン生成菌のエネルギー代謝　　　嶋　盛吾
　第８節　新しい生理活性物質探査源としての未開拓粘液細菌の探索
　　　　　　　　　　　　　　　　不藤 亮介／山中　茂

特別座談会　将来の大展開に向けて−第１編


第２編　微生物の操作法
第１章　観察法
　第１節　顕微鏡による観察
　　１．光学顕微鏡　　　　　　　魚住 孝之／坂口 一紀
　　２．実体顕微鏡・光学顕微鏡による糸状菌の観察　　　矢口　貴志
　　３．蛍光顕微鏡
　　　　蛍光顕微鏡による細菌観察法　佐藤 孝子／
　　　　in situハイブリダイゼーション法　平山 仙子／
　　　　蛍光顕微鏡を用いた酵母菌の観察　阿部 文快／
　　　　レーザ顕微鏡等特殊光学顕微鏡　砂村 倫成／丸山 明彦／
　　　　電子顕微鏡による観察　大隅 正子／
　　　　走査プローブ顕微鏡　永井 浩二／鈴木 賢一
　第２節　高圧顕微鏡の開発と実用
　　１．微生物・細胞　　　三輪 哲也
　　２．超臨界水中での生体物質の観察を目的とした
　　　　高温・高圧顕微鏡の開発　　　出口　茂／辻井　薫／掘越 弘毅
第２章　遺伝子発現法
　第１節　細菌
　　１．大腸菌　　　川上 文清
　　２．枯草菌　　　関口 順一
　第２節　酵母
　　１．Saccharomyces cerevisiae　　　原島　俊
　　２．メタノール資化性酵母による異種遺伝子発現　　　阪井 康能
　第３節　糸状菌　　　北本 勝ひこ
第３章　遺伝子解析法
　第１節　突然変異誘発法　　　　　　　　加藤 純一
　第２節　遺伝子マッピング　　　　　　　金井　保
　第３節　遺伝子クローニング　　　　　　金谷 茂則
　第４節　DNAの塩基配列決定法 　　　　　跡見 晴幸
　第５節　PCR法 　　　　　　　　　　　　高木 昌宏
　第６節　LCR法−−原理と方法論 　　　　江崎　聡
　第７節　遺伝子の人為的改変　　　　　　栗原 達夫
　第８節　形質転換法　　　　　　　　　　黒田 章夫
　第９節　環境微生物の群集構造解析　　　稲垣 史生
第４章　微生物の培養法
　第１節　培養の基本操作と培養装置
　　１．基本培養操作　　　　　　　　　　小林　猛／佐藤 一博
　　２．工業生産の培養装置と操作法　　　佐藤 一博／小林　猛
　　３．通気撹拌培養の理論と実際　　　　小林　猛／佐藤 一博
　第２節　培養プロセスの様式と制御
　　１．微生物の生育速度論と数式モデル　　　塩谷 捨明
　　２．回分培養，流加培養，連続培養　　　　塩谷 捨明
　　３．計測技術　　　　　　　　　　　　　　塩谷 捨明
　　４．培養プロセスの制御　　　　　　　　　塩谷 捨明
　第３節　個別培養方法の特徴と実際
　　１．高粘度培養　　正田　誠
　　２．固体培養　　　正田　誠
　　３．嫌気培養　　　金井　保
　　４．透析培養　　　正田　誠
　　５．混合培養の実際（その１）：活性汚泥法　　　　　古川 憲治
　　６．混合培養の実際（その２）：有用物質の生産　　　横田　篤
　　７．高圧培養　　　加藤 千明

特別座談会　将来の大展開に向けて−第２編


第３編　微生物の応用技術
第１章　伝統的バイオテクノロジー
　第１節　酒類の製造
　　１．ビール　　　　　　　　　柴田 和憲
　　２．ワイン醸造における微生物の関与　　　庄内 文雄
　　３．日本酒（清酒）　　　　　梅原 康夫
　　４．焼酎　　　　　　　　　　下田 雅彦
　第２節　調味料の製造
　　1.味　噌　　　　　　　　　　安平 仁美
　　2.醤　油　　　　　　　　　　吉井 寛依／細谷 広志／諸沢 英明／本村 敏明
　　3.食　酢　　　　　　　　　　森　　浩孝／上中居和男
　第３節　発酵乳製品
　　1.チーズの微生物　　　　　　水谷　潤
　　2.ヨーグルトの微生物　　　　水谷　潤
　第４節　納豆菌のバイオテクノロジー　　　　伊藤 義文
　第５節　パンの製造　　　　　　河合 弘康
第２章　代謝制御発酵−−アミノ酸，核酸，抗生物質生産，
　　　　メタボリックエンジニアリング
　第１節　代謝制御発酵とは　　　中森　茂
　第２節　アミノ酸　　　　　　　中森　茂
　第３節　核酸−−うま味ヌクレオチド　　　　柴井 博四郎
　第４節　抗生物質　　　　　　　庄村　喬
　第５節　メタボリックエンジニアリング　　　清水　浩
第３章　遺伝子組換え体を用いた新機能の導入
　第１節　医薬分野
　　１．組換えヒト成長ホルモンの製造　　　　穂積 龍信
　　２．インターロイキン-２および-６（IL-2，6）の大腸菌での発現生産
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　安枝　寿／松井　裕
　　３．エリスロポエチン　　　　　　　　　　大橋 秀哉
　　４．組換えヒトインスリンの製造　　　　　穂積 龍信
　　５．遺伝子改変ヒトG-CSF　　　　　　 　　横尾 義春／久我 哲郎
　　６．トロンボポエチン　　　　　　　　　　加藤 尚志
　　７．遺伝子組換えヒト血清アルブミン　　　小林　薫
　第２節　食品分野
　　１．チーズ産業におけるムコールレンニンとウシキモシン
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　山下　隆／城之内 末治
　　２．トランスグルタミナーゼ　　　　　　　横山 敬一／小林 克徳／安枝　寿
　第３節　その他の分野
　　１．酵素：診断薬　　　手嶋 眞一／山本 和巳／西矢 芳昭
　　２．EGF：羊採毛 　　　高木 広明
第４章　環境浄化
　第１節　バイオレメディエーション技術　　　矢木 修身
　第２節　排水中の有機物，BOD除去　　　 　　中村 和憲
　第３節　活性汚泥微生物による下水からのリン回収技術　　　大竹 久夫
　第４節　排水の窒素除去とN2O抑止　　　 　　祥雲 弘文
　第５節　重金属の除去
　　１．水　銀　　　　　　遠藤 銀朗
　　２．六価クロムの微生物処理　　　大竹 久夫
　第６節　揮発性有機塩素化合物の分解・除去
　　１．TCE，PCE　　　　　矢木 修身
　　２．PCB　 　　　　　　古川 謙介
　　３．ダイオキシン　　　近藤 隆一郎
　第７節　微生物による石油汚染の浄化　　　珠坪 一晃／原山 重明
　第８節　その他の有害汚染物質の分解除去
　　１．内分泌かく乱物質の微生物分解　　　大森 俊雄／吉田 貴子
　　２．農薬の微生物分解　　　福田 雅夫
　　３．合成高分子　　　　　　河合 富佐子
　　４．悪臭物質　　　　　　　金川 貴博
　　５．排ガス中の窒素酸化物の除去　　　　宮本 和久／永瀬 裕康／平田 收正
　第９節　有害微生物の除去
　　１．赤潮の予防と駆除　　　今井 一郎／吉永 郁生
　　２．アオコ　　　　　　　　齊木　博
　第10節　バイオエコモニタリング　　　　　三宅　淳／中村　史
第５章　副産物，廃棄物の有効利用
　第１節　酒かす類の利用　　　梅原 康夫
　第２節　ビール酵母の利用−−乾燥酵母，酵母エキス　　　小林 富二男／加戸 久生
　第３節　アミノ酸製造廃液の有効利用　　　吉村　実
　第４節　酵素固体培養廃液物の利用−−廃ふすまの肥料化　　　酒井 敏秀

特別座談会　将来の大展開に向けて−第３編


第４編　微生物の生体成分利用
第１章　生体触媒の利用
　第１節　微生物酵素
　　１．工業用酵素：洗剤　　　　　　伊藤　進
　　２．工業用酵素：デンプン加工　　栗木　隆
　　３．工業用酵素：その他　　　　　上島 孝之／内田 博之
　　４．物質生産のための生体触媒の探索と開発　　　清水　昌
　第２節　その他の生体触媒
　　１．高効率リボザイム発現系の開発　　　澤田 愼矢／多比良和誠
　　２．抗体触媒　　　　藤井 郁雄
第２章　機能性生体成分の利用
　第１節　脂　質　　　　中原 東郷
　第２節　ビタミン　　　和泉 好計／大城　隆
　第３節　バイオサーファクタント　　　森川 正章
　第４節　生分解性プラスチックとしての微生物ポリエステル　　　福居 俊昭
　第５節　バイオポリマー−−エキソポリサッカライド　　　　　　飯塚　勝
第３章　分析法
　第１節　遺伝子分析法
　　１．環境中の微生物モニタリング　　　山口 進康／那須 正夫
　　２．遺伝子診断法　　　　　　　　高木 昌宏
　　３．LCR法による変異の検出　　 　江崎　聡
　　４．DNAチップ（マイクロアレイ）の利用による
　　　　遺伝子発現の解析　　　　　　峰野 純一／加藤 郁之進
　第２節　酵素を用いる生体成分分析と診断薬としての利用
　　　　　−−酵素的測定法　　　　　西矢 芳昭
　第３節　バイオセンサ　　　　　　　横山 憲二

特別座談会　将来の大展開に向けて−第４編


第５編　微生物の将来展望
第１章　微生物による炭酸固定
　第１節　炭酸固定経路　　　　　　　　　　　跡見 晴幸
　第２節　光合成細菌（ラン藻も含む）　　　　藤井 貴明
　第３節　化学合成独立栄養微生物　　　　　　石井 正治
　第４節　微生物による新規炭酸固定反応　　　乾　将行／湯川 英明
第２章　バイオエネルギーの生産
　第１節　バイオマスの利用　　　　　　　　　桑原 正章
　第２節　生物的水素生産　　　　　　　　　　淺田 泰男／三宅　淳／宮本 和久
　第３節　生物的メタン生産　　　　　　　　　西尾 尚道／中島田　豊
　第４節　生物的石油生産　　　　　　　　　　今中 忠行
　第５節　複合酵素反応によるATPの生産　　 　藤尾 達郎
　第６節　静止菌体のATP再生活性を利用した物質生産法　　　藤尾 達郎
第３章　グリーンテクノロジー−廃棄物処理，ゼロエミッション，リサイクル
　第１節　世界の動向，日本の動向　　　　　　倉根 隆一郎
　第２節　ボトルネックとポテンシャル　　　　倉根 隆一郎
　第３節　LCAとグリーンテクノロジー　　 　　稲葉　敦
　第４節　ケーススタディ
　　1.グリーンプロダクト　　　　　　　　　　伊藤　進
　　2.ゼロエミッションネットワークとグリーンテクノロジー　　　吉田 弘之

　第５節　R & Dとオポチュニティー　　　 　　　倉根 隆一郎

特別座談会　将来の大展開に向けて−第５編／本ハンドブックの結びに代えて
　　　　　　−−微生物利用の未来展望「ヒトよりすごい微生物遺伝子」